Představujeme Vám špičkové, plně integrované řešení pro analýzu methylace metodou NGS, které kombinuje bezprecedentní rychlost, citlivost a přesnost výsledků. Naše workflow pokrývá celý proces od přípravy knihoven až po klinickou interpretaci dat.
Příprava NGS knihoven: Agilent Avida DUO
Technologie Agilent Avida přináší revoluci v multiomické analýze tekutých i tkáňových biopsií.
- DNA i methylace z jednoho vzorku: Jako jediné řešení na trhu umožňuje Avida DUO získat profil variant (SNV, INDEL, CNV, translokace) i stav methylace z jediného vzorku bez nutnosti jeho dělení (splitting).
- Ultrarychlé workflow: Celý proces přípravy je optimalizován tak, aby minimalizoval ztráty vzorku a čas. Od extrakce cfDNA k sekvenování se dostanete v řádu hodin, nikoliv dnů (např. workflow Avida Duo pro přípravu DNA i methylovaných knihoven trvá cca 8,5 hodiny).
- Vysoká citlivost: Ideální pro nízké vstupní množství vzorku (včetně cfDNA a FFPE)
Sekvenování: MGI DNBSEQ-G99
Pro maximální efektivitu využíváme sekvenátor MGI DNBSEQ-G99, který vyniká v klíčových parametrech
- Rychlost a flexibilita: G99 je navržen pro rychlou analýzu knihoven a flexibilní sekvenační výstup, což perfektně doplňuje rychlou přípravu knihoven Agilent Avida.
- Vysoká přesnost: Díky technologii DNB (DNA Nanoball) poskytuje sekvenování s minimální mírou chybovosti, což je zásadní pro detekci vzácných variant v onkologické diagnostice.
Analýza dat: SeqOne (SomaMethyl)
Analytická platforma SeqOne zajišťuje rychlou a srozumitelnou interpretaci získaných dat.
- Rychlost zpracování: Turn-around time (TAT) analýzy je přibližně 3 hodiny od nahrání FASTQ souborů po vygenerování reportu.
- Plug & Play kompatibilita: Plně optimalizováno pro Agilent AVIDA DUO DMR 3400.
- Klíčové parametry: Analýza pokrývá base-level methylaci CpG míst, identifikaci diferenčně methylovaných oblastí (DMRs) a výpočet Methylation Index (MI).
- Bezpečnost: Cloudové i on-premise řešení s certifikací ISO 27001 a evropským úložištěm dat.
Aplikační podpora v celém workflow.
Naším cílem není pouze dodat špičkové produkty, ale zajistit jejich hladký provoz ve Vaší laboratoři. Poskytujeme komplexní aplikační a technickou podporu v každém kroku workflow – od nastavení protokolů pro automatizaci na platformě Agilent Bravo až po asistenci s bioinformatickou analýzou.
Máte zájem o více informací nebo demo ukázku tohoto ultrarychlého workflow? Neváhejte nás kontaktovat genomics_sales.cz@altium.net.