Systémy Agilent 1260 Infinity II SFC jsou plně kompatibilní s MS detektory Agilent. Propojení lze realizovat v režimu full flow nebo split. Pro zajištění účinnosti ESI ionizace je efluent z kolony míchán s make-up rozpouštědlem, které je pumpováno make-up pumpou. V režimu full flow je efluent míchán s make-up rozpouštědlem a poté veden zpět do kontrolního modulu a z něj do MS detektoru bez dělení toku. V režimu s dělením toku (split) je využit dedikovaný splitter, do něhož je přiváděno make-up rozpouštědlo, tok je dělen, část se vrací do kontrolního modulu pro zajištění zpětného tlaku systému a část je vedena do MS detektoru.
Režim Full Flow
Režim s dělením toku (Split)