SureSelect Cancer CGP Assay

(Comprehensive Genomic Profiling)

Komplexní NGS (Next Generation Sequencing) řešení umožňující jednorázově vyšetřit vzorky solidních tumorů na přítomnost genomových změn (včetně genových translokací a fúzí) souvisejících s nádorovým onemocněním. A to v 679 klinicky relevantních genech testem DNA a v 80 genech testem RNA.

Agilent SureSelect Cancer CGP Assay je komplexní test pro genomové profilování, který maximalizuje vhled do změn v genomu nádorových buněk solidních tumorů, posouvá potenciál přesně cílené onkologické léčby na novou úroveň a je tak vynikajícím podpůrným nástrojem pro klinické rozhodování.

Hlavní přednosti

Rozsáhlý soubor biomarkerů pro geny související s nádorovým onemocněním
Paralelní test DNA i RNA
Přizpůsobení vstupního množství NK vzorku (10-200 ng)
Výsledky v krátkém čase
Možnost automatizace pro lepší produktivitu a reprodukovatelnost výsledků
Možnost volby enzymatické namísto mechanické fragmentace NK pro vysokou komplexitu knihovny a uniformitu pokrytí
Příprava knihovny na platformě SureSelect XT HS2
Molekulární barkódy pro vyšší citlivost a detekci i řídce se vyskytujících alelických variant

Test využívá platformu SureSelect XT HS2, která zajišťuje aktualizovaný soubor biomarkerů pro vyšetřované genya poskytuje cennou informaci i o nádorové mutační zátěži (TMB) a mikrosatelitní nestabilitě (MSI), a to v jediném testu. Vyšetřované geny testem SureSelect Cancer CGP Assay byly zvoleny na základě vysoce relevantních zdrojů, zavedených klinických doporučení, probíhajících klinických studií, databází somatických nádorů a konzultací s předními odborníky v onkologické oblasti.

Účinný pracovní postup je automatizovatelný a navíc pomáhá zpřístupnit výsledná data odborné komunitěv oblasti klinického výzkumu.

Test SureSelect Cancer CGP Assay poskytuje vysoce kvalitní výsledky jak při použití FFPE vzorků, tak čerstvě zmrazených tkání. Modulární design testu SureSelect Cancer CGP nabízí flexibilní pracovní postupy pro testy genomové DNA i celkové RNA, které lze provádět jak samostatně tak i paralelně.

Možnost automatizace testu SureSelect Cancer CGP

Pracovní postup SureSelect Cancer CGP nabízí pohodlné možnosti automatizace pro zvýšení efektivity laboratoře s výběrem ze dvou automatizačních platforem: automatizační systém Agilent Magnis NGS Prep nebo automatizační systém Agilent Bravo NGS pro vyšší počty vzorků. Oba systémy používají enzymatickou fragmentaci a čištění vzorku pomocí kuliček. Tyto automatizační systémy výrazně zkracují čas nutný pro přípravu knihovny a target enrichment a minimalizují potenciální chyby při manipulaci se vzorky.

Automatizační systém Magnis NGS

Automatizační systém Magnis NGS
Zpracujte až 8 vzorků na běh a až 2 běhy denně
Snímání čárových kódů reagencií pro integrovanou kontrolu procesu
Integrované UV světlo pro dekontaminaci mezi běhy pro zajištění kvality

Automatizační systém Bravo NGS

Vysoce výkonný stolní systém určený k manipulaci s kapalinami ve větším měřítku a s reprodukovatelností i při větším počtu vzorků
Otevřený systém poskytuje flexibilitu pro úpravu protokolů
Škálování z osmi na 96 vzorků na běh bez snížení kvality dat

Sekvenování

Test SureSelect Cancer CGP je možné sekvenovat na MGI i ostatních běžně používaných sekvenačních systémech.

Analýza dat

Pro test SureSelect Cancer CGP nabízíme kompletní analýzu dat, včetně vyhodnocení translokací a genových fúzí, a to pomocí softwaru od firmy Genoox.