Termíny školení

Registrace z důvodu vyčerpání kapacity obou termínů je UKONČENA.


Kurz je určen pro pracovníky výzkumných a diagnostických laboratoří, kteří si chtějí prohloubit základní znalosti v genomice a analýze sekvenačních dat. 

Jednodenní kurz vám pomůže zorientovat se v základech bioinformatické analýzy a naučí vás účelně využívat dostupné genomické databáze jako NCBI a UCSC. Dále vám přiblíží základní principy jednotlivých sekvenačních technik a poodhalí význam nejčastěji používaných formátů genomických dat (FASTA, FASTQ, SAM/BAM, VCF,  BED ...). Kurz probíhá v malém kolektivu a je možné diskutovat libovolná témata týkající se genomiky a NGS. Náplň je orientovaná především na lidskou genomiku.

Kurz proběhne ve dvou termínech: 23. 11. 2022 a  30. 11. 2022.
Vždy v čase 9:00 - 17:00.
V případě zájmu se kurzu zúčastnit, vyberte si termín v rámci registračního formuláře. 

Registrační formulář zde

Délka školení: 1 den

Místo: ve školící místnosti HPST, s.r.o., Na Jetelce 69/2, Praha 9 (v blízkosti Nádraží Vysočany) - mapa

Cena: 5.800,- Kč bez DPH/osoba

Počet osob: 8

Pro více informací: Mgr. Tomáš Hron, Ph.D., tel. 605 325 350 nebo piště na e-mail tomas.hron@hpst.cz

Program: Probírány budou základy běžných genomických analýz a principy sekvenace nové generace. Dále si vyzkoušíte práci s genomickými databázemi a nástroji, které vám umožní získat potřebná data (UCSC genome browser, UCSC table browser, Ensembl Variant Effect Predictor). V neposlední řadě vám budou také stručně představeny možnosti pro pokročilejší práci s genomickými daty (Galaxy, MySQL aj.). Náplň kurzu se pokusíme maximálně přizpůsobit vašim potřebám.

Teoretická část:

  1. Princip sekvenačních technologií
  2. Základy analýzy NGS dat
  3. Struktura genomických databází

Praktická část

  1. Práce s genomickými daty
  2. UCSC Genome Browser / NCBI
  3. Užitečné genomické nástroje (BLAST/BLAT, Ensembl Variant Effect Predictor… )

V případě dalších dotazů neváhejte kontaktovat školitele kurzu. 

Školitelé
Tomáš Horn
Tomáš Hron
Bioinformatik (Skupina genomiky a diagnostiky)
Mária Šurinová
Aplikační specialista, bioinformatik (skupina genomiky a diagnostiky)
Galerie

Servis

Servisní
požadavek

Přejít na formulář

Rychlé odkazy

Servis
Servisní tým
 

HPST webináře
Záznamy webinářů
 

Zůstaňte s námi v kontaktu

Odběr newsletteru

Přihlásit se k odběru