Společnost Weck Laboratories vyvinula a uvedla do praktického využití citlivý a spolehlivý postup určený k analýze přítomnosti viru SARS-CoV-2 v odpadních vodách s využitím RNA izolačních souprav, qRT-PCR reagencií a přístrojového vybavení od Agilent Technologies.
Vzorek odpadní vody je pasterizován, prochází dvojnásobnou filtrací a RNA je izolována pomocí kolonkové izolační metody. Přítomnost viru SARS-CoV-2 je prokazována qRT-PCR reakcí s využitím cílových sekvencí N1 a N2 s primery a sondami CDC-EUA SARS-CoV-2.
Metoda, její vývoj a validace jsou podrobně popsány v aplikační poznámce Agilent Technologies The Development of a Sensitive and Reliable qRT-PCR-Based SARS-CoV-2 Wastewater Analysis Protocol
Doporučujeme webinář, ve kterém Dr. Augustin Pierri z Weck Laboratories podrobně popisuje vývoj a využití zmíněné metody: Genomewebinar: learn how researchers developed a qPCR-based SARS-CoV-2 analysis protocol | Agilent. Doporučujeme ke shlédnutí.
Použité reagencie a přístroje:
Podrobné informace k použitým reagenciím najdete v brožuře Real-Time PCR Catalog (agilent.com).
Izolace RNA: Agilent Absolutely RNA Miniprep
qPCR master mix: Agilent Brilliant III Ultra-Fast qRT-PCR Master Mix
Real-Time PCR Cykler: Agilent AriaMX Real-Time PCR System
Pro další informace kontaktujte produktového specialistu Aleš Merta, ales.merta@hpts.cz