Jednodenní kurz je určen pro pracovníky výzkumných a diagnostických laboratoří, kteří se chtějí naučit, či si prohloubit, základní znalosti v práci s genomickými databázemi. Celý kurz bude zaměřen především na praktické využití webové platformy UCSC Genome Browser. Ta nabízí celou řadu funkcionalit. Kromě vizualizace dat v kontextu referenčního genomu člověka a jiných druhů nabízí platforma řadu užitečných nástrojů jako vyhledávání na základě sekvenční homologie, konverze genomických koordinát mezi verzemi referenčních genomů či filtrování a export genomických dat.
Kurz probíhá v malém kolektivu a je možné diskutovat libovolná témata týkající se genomiky a NGS. Náplň je orientována především na lidskou genomiku. Od účastníků se očekává základní znalost genetiky a molekulární biologie. Znalost NGS je výhodou.
Co je náplní praktického kurzu?
- Formáty dat v genomice
- Genomické databáze a jejich fungování
- Referenční genomy a anotace
- Konfigurace a uživatelské nastavení UCSC GB
- Vizualizace dat a tracky v UCSC GB
- Nástroje v UCSC GB
- Track Hubs v UCSC GB
- Filtrování a stahování dat pomocí Table Browser
Počet účastníku je maximálně 8.
Termín: 14. 5. 2024
V čase 9:00 - 17:00.
Kde: Altium International s.r.o., Na Jetelce 69/2, Praha 9 - Vysočany
Cena: 6 200 Kč bez DPH / osoba (včetně drobného občerstvení a oběda)
V případě dotazů kontaktujte školitele na jeho e-mail, nebo telefonicky.
Těšíme se na setkání.
