Začátek kurzu v 9 hodin, zakončení v 17 hodin
Tento kurz je určen pro všechny, kteří chtějí získat přehled a hlubší porozumění nástroje Varsome Clinical.
Součástí jednotlivých částí programu jsou praktické příklady. Kurz bude probíhat ve skupině s menším počtem účastníků, což umožní volnější diskusi a lepší porozumění jednotlivých témat.
Program kurzu:
- Úvod do VarSome Clinical: účel, porovnání Varsome Clinical a Premium, kontrola a implementace panelů, moznosti administrátorských a uživatelských účtů, updaty
- Přehled a logika funkcionalit: možnosti funkcionalit (samples, workflows, analýz, post-analýz a gene lists)
- Alignment a variant calling: stručné vysvětlení pipelin a jejich důsledky pro analýzu, quality filtry, QC report, chyby reportované v FASTQC
- Tabulka variant: co nám napovídá BAM a VCF file, vysvětlení pojmů, filtrování (dynamické a algoritmické filtry), pomocníci při rozhodování (IGV, USCS GB, reporty), ACMG klasifikace, in silico predikce, artefakty
- CNV analýza: stručné vysvětlení pipeliny, tabulky variant a limity analýzy
- Otázky a diskuse: moznost zaslat předem své specifické otázky
Pokud Vám nevyhovuje termín, prosím kontaktujte nás, změna termínu možná.
Délka školení: 1 den
Začátek a konec: 9:00 až 17:00
Místo: ve školící místnosti Altium International s.r.o., Na Jetelce 69/2, Praha 9 (v blízkosti Nádraží Vysočany) - mapa
Cena: 3 000 Kč bez DPH (včetně drobného občerstvení)
Počet osob: 12
Pro více informací: RNDr. Mária Šurinová, Ph.D., tel. 605 791 379 nebo piště na e-mail maria.surinova@hpst.cz.
Pokud Vám nevyhovuje termín, prosím kontaktujte nás, změna termínu možná.