SureCall aneb analýza dat z NGS

Používáte NGS produkty od Agilent Technologies (SureSelect, Haloplex) a chtěli byste více vědět o tom, jaké možností nabízí Agilent pro analýzu dat?

  • Chcete více prozkoumat možnosti anotování vašich dat? Nemůžete se vyznat ve formátech, které se používají v NGS (FASTQ, FASTA, BAM, SAM, BED, VCF)?
  • Nabízíme vám jednodenní školení, díky kterému budete moci lépe analyzovat a porozumět Vašim datům.

 

Školitel: Mgr.Tomáš Hron

Datum: dle domluvy s vámi

Délka školení: přibližně 7 hodin

Místo: HPST, s.r.o. nebo přímo na vašem pracovišti

Cena: 4500 Kč/osoba  včetně DPH nebo školení u vás v laboratoři - 10500 Kč včetně DPH

Více informací nebo přihláška: dgg [at] hps.cz nebo přímo u Tomáše Hrona na tel. 605 325 350 nebo thron [at] hpst.cz.

  

Program: Školení začneme seznámením s technologii NGS z bioinformatického hlediska. Ukážeme si, jak lze zkontrolovat kvalitu dat pomocí FASTQC. Dále podrobně projdeme zpracování vzorků v SureCall se zaměřením na porozumění parametrům analýzy.  Zjistíme, jak lze anotovat data (ClinVar, OMIM, UniProt) a co znamenají hodnoty predikce významu mutace (SIFT, PolyPhen). Vyzkoušíme si webový nástroj pro anotaci a prohlížení dat (variant effect predictor).

Za absolvování školení obdržíte certifikát.

Velkou část školení věnujeme analýze a konzultaci výsledků Vašich dat. Všechny použité materiály a zdroje Vám poskytnutneme i v elektronické podobě.

 

Ohlasy předchozích účastníků

"Školení mě se zaplnilo plno "černých" míst, obzvlášť ve zpracování surových NGS dat."

-- Mgr. Diana N. Grochová, Ph.D., Cytogenetická laboratoř Brno

 

"Děkuji za velmi cenné informace, krásně srozumitelně a přitom velmi kvalifikovaně podané."

-- Mgr. Josef Včelák, Endokrinologický ústav, Oddělení molekulární endokrinologie